原子钟的工作原理是利用原子或分子的能级跃迁频率的高度稳定性来作为计时标准。当原子或分子吸收或释放能量时，它们会发生能级跃迁。能级跃迁的频率非常稳定，而且不受温度、湿度、气压等外界条件的影响。因此，原子钟可以提供非常精确的时间。

原子钟的应用非常广泛。在导航领域，原子钟可以为飞机、轮船、潜艇等交通工具提供精确的定位信息。在通信领域，原子钟可以为无线电通信、卫星通信等提供精确的同步信号。在科学研究领域，原子钟可以用于测量物理常数、研究原子和分子结构等。