吉祥纹莲花楼是一座重檐歇山顶建筑，通高30.4米，宽57.3米，进深33.7米，占地面积1920平方米。楼体由汉白玉须弥座、汉白玉雕刻的莲花柱、斗拱和屋顶组成。吉祥纹莲花楼的屋顶采用重檐歇山顶的形式，屋脊上装饰有琉璃宝顶、垂脊、戗脊和脊兽。吉祥纹莲花楼外檐墙上装饰有砖雕、琉璃画、石雕等。其中，砖雕主要集中在楼体下部的须弥座和藻井上，砖雕内容包括花鸟、龙凤、祥云等。琉璃画主要集中在楼体上部的檐部，琉璃画内容包括龙凤、花鸟、吉祥云彩等。石雕主要集中在楼体下部的踏道和栏板上，石雕内容包括狮子、象鼻、福禄寿三星等。

吉祥纹莲花楼是故宫中轴线上最为壮丽的建筑之一，也是北京城内现存最完整的古代宫殿建筑之一。吉祥纹莲花楼的建筑风格具有鲜明的满汉文化特色，是北京故宫的重要组成部分。