怪盗基德和黑衣组织的第一次交锋是在漫画的第12卷中。当时，怪盗基德潜入黑衣组织的基地，偷走了组织的秘密文件。黑衣组织大为震怒，派出了琴酒和伏特加追杀怪盗基德。在一番激烈的交锋之后，怪盗基德成功逃脱，而黑衣组织的阴谋也被公之于众。

从那以后，怪盗基德和黑衣组织就成为了不死不休的敌人。黑衣组织多次试图抓捕怪盗基德，但都以失败告终。而怪盗基德也多次挫败黑衣组织的犯罪计划，让组织损失惨重。

在漫画的第35卷中，怪盗基德和黑衣组织的斗争达到了白热化的程度。当时，怪盗基德潜入黑衣组织的总部，与琴酒展开了一场激烈的对决。在一番激烈的交锋之后，怪盗基德终于打败了琴酒，并摧毁了黑衣组织的总部。

黑衣组织的覆灭标志着怪盗基德与黑衣组织的斗争终于落下帷幕。这场斗争可谓是精彩绝伦，令人拍案叫绝。