作为《新世纪福音战士》新剧场版的最终章，《终结的福音战士新剧场版》承载着众多粉丝的期待。影片讲述了碇真嗣和他的伙伴们在第三次冲击后的世界中，对抗使徒和SEELE组织的故事。

在经历了无数的苦难与牺牲后，碇真嗣终于找回了自我，并明白了生命与希望的真谛。他与明日香、绫波丽等人携手，共同对抗着最后的使徒——新二号机。

战斗中，真嗣的觉醒引发了奇迹，他获得了能够改变命运的力量。在伙伴们的帮助下，真嗣成功阻止了新二号机的暴走，并创造出了一个全新的世界。

在新世界中，不再有使徒和SEELE组织的威胁，人们可以自由地生活。碇真嗣和他的伙伴们也终于迎来了久违的平静与幸福。

《终结的福音战士新剧场版》不仅是新剧场版的完结篇，更是整个《新世纪福音战士》系列的终章。它为这个充满争议与思考的动漫画上了一个圆满的句号。