《疯狂动物城2》的故事发生在第一部电影事件之后，朱迪和尼克已经成为了警局的明星搭档，他们共同破获了许多大案，维护了动物城的和平与秩序。然而，一场新的危机正在悄然降临，一只名叫“霍腾”的绵羊被指控袭击了“掠食者”的领导人，这引发了动物城内部的恐慌和猜忌，兔子和狐狸之间的矛盾也再度加剧。

为了查明真相，朱迪和尼克必须深入调查，他们接触了各种各样的动物，包括狡猾的狐狸、强大的狮子、神秘的猫头鹰等等，每一个角色都有着各自的秘密和故事。在这个过程中，他们不仅要面对来自外界的压力，还要克服彼此之间内心的隔阂，最终他们将携手揭开真相，并带领动物城走向更美好的未来。

与第一部相比，《疯狂动物城2》在剧情、角色、主题等方面都有了很大的提升，影片更加注重探讨动物世界多元化和包容性，展现了不同动物之间如何理解、尊重和包容。同时，影片也充满了幽默、温情和冒险的元素，能够带给观众们耳目一新的感受。